Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ptpn11P35235 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptpn11P35235 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms