Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pola1P33609 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola1P33609 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pola1P33609 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pola1P33609 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pola1P33609 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms