Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc10P31257 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc10P31257 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms