Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vcam1P29533 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vcam1P29533 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms