Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a9P28571 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms