Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apex1P28352 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apex1P28352 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms