Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LoxP28301 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LoxP28301 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LoxP28301 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LoxP28301 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LoxP28301 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms