Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aco1P28271 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aco1P28271 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aco1P28271 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aco1P28271 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aco1P28271 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aco1P28271 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms