Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb1P28230 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb1P28230 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms