Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms