Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PdgfraP26618 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PdgfraP26618 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms