Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CftrP26361 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CftrP26361 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CftrP26361 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CftrP26361 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CftrP26361 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CftrP26361 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CftrP26361 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CftrP26361 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CftrP26361 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CftrP26361 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CftrP26361 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CftrP26361 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CftrP26361 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CftrP26361 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CftrP26361 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CftrP26361 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CftrP26361 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CftrP26361 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CftrP26361 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CftrP26361 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CftrP26361 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CftrP26361 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CftrP26361 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CftrP26361 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CftrP26361 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms