Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f1P21952 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms