Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Abcb1aP21447 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Abcb1aP21447 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms