Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prim1P20664 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prim1P20664 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prim1P20664 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms