Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fcer1aP20489 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms