Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP20293 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP20293 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TP20293 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TP20293 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TP20293 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TP20293 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TP20293 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TP20293 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TP20293 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms