Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P18532 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18532 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18532 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P18532 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18532 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18532 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18532 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18532 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18532 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18532 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18532 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms