Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms