Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa-rs1P17533 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Defa-rs1P17533 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms