Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sptan1P16546 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms