Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkceP16054 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkceP16054 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkceP16054 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PrkceP16054 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms