Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf271P15620 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf271P15620 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf271P15620 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf271P15620 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms