Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nme1P15532 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nme1P15532 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms