Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DmdP11531 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DmdP11531 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DmdP11531 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
DmdP11531 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DmdP11531 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DmdP11531 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DmdP11531 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DmdP11531 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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DmdP11531 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DmdP11531 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DmdP11531 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DmdP11531 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DmdP11531 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DmdP11531 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DmdP11531 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DmdP11531 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DmdP11531 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms