Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6c1P0CW02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms