Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprqP0C5E4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprqP0C5E4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms