Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col3a1P08121 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col3a1P08121 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col3a1P08121 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms