Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CfhP06909 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CfhP06909 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CfhP06909 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CfhP06909 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CfhP06909 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CfhP06909 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CfhP06909 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CfhP06909 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CfhP06909 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CfhP06909 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CfhP06909 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CfhP06909 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CfhP06909 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CfhP06909 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CfhP06909 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CfhP06909 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CfhP06909 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CfhP06909 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms