Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P06321 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P06321 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P06321 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P06321 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P06321 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P06321 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P06321 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P06321 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms