Protein–RNA interactions for Protein: P04946

Ig kappa chain V-V region NQ5-89.4, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04946 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04946 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04946 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04946 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04946 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04946 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04946 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04946 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04946 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04946 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04946 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04946 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04946 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04946 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04946 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04946 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04946 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04946 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04946 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms