Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01915 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01915 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01915 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01915 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01915 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P01915 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P01915 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P01915 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms