Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-K1P01901 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-K1P01901 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2-K1P01901 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2-K1P01901 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-K1P01901 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms