Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01837 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01837 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01837 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01837 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01837 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms