Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01728 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01728 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01728 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01728 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01728 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01728 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01728 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01728 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms