Protein–RNA interactions for Protein: P01726

Ig lambda-1 chain V region H2020, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01726 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01726 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01726 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01726 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01726 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01726 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01726 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01726 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms