Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01669 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01669 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01669 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01669 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01669 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01669 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01669 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01669 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01669 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01669 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01669 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01669 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01669 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01669 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01669 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01669 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01669 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms