Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01660 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01660 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01660 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01660 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01660 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01660 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01660 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01660 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01660 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01660 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01660 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms