Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01655 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01655 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01655 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01655 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01655 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01655 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01655 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms