Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01649 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01649 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01649 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01649 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01649 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01649 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01649 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01649 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms