Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01630 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01630 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01630 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01630 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01630 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01630 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01630 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01630 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01630 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01630 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01630 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01630 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01630 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01630 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms