Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna1P01572 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms