Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtatp6P00848 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms