Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ccl20O89093 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ccl20O89093 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Ccl20O89093 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl20O89093 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ccl20O89093 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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