Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tcn2O88968 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tcn2O88968 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms