Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apaf1O88879 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Apaf1O88879 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms