Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F11rO88792 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F11rO88792 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F11rO88792 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
F11rO88792 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
F11rO88792 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
F11rO88792 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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