Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BlmO88700 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BlmO88700 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BlmO88700 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BlmO88700 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BlmO88700 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BlmO88700 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BlmO88700 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BlmO88700 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BlmO88700 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BlmO88700 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
BlmO88700 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
BlmO88700 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BlmO88700 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BlmO88700 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BlmO88700 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BlmO88700 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BlmO88700 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BlmO88700 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BlmO88700 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BlmO88700 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms