Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mid1O70583 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mid1O70583 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1O70583 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms