Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SfnO70456 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SfnO70456 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SfnO70456 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SfnO70456 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SfnO70456 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SfnO70456 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SfnO70456 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SfnO70456 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SfnO70456 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SfnO70456 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SfnO70456 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SfnO70456 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SfnO70456 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SfnO70456 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SfnO70456 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SfnO70456 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SfnO70456 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SfnO70456 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SfnO70456 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SfnO70456 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SfnO70456 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SfnO70456 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SfnO70456 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SfnO70456 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SfnO70456 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SfnO70456 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SfnO70456 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SfnO70456 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SfnO70456 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SfnO70456 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms